Jean Chartier attaqua devant le Parlement la décision de l’exclure prise par la Faculté. Le ms BIU Santé n^o 2007 conserve le brouillon (en français) de la plaidoirie que Guy Patin prononça devant la Cour pour défendre la cause de la Faculté ou, pour mieux dire, sa cause personnelle (v. note [19], lettre 277). Le procès que Patin et la Faculté allaient perdre n’eut lieu qu’en juillet 1653.