Charles Patin demeura professeur de pathologie jusqu’en novembre 1660. Comme les docteurs régents de la Faculté de médecine de Paris y étaient alors parfois autorisés, il continua à donner ensuite chez lui des leçons privées d’anatomie et de chirurgie.

Dans son article Charles Patin in Paris… [Charles Patin à Paris…], Christian E. Dekesel (v. notule {c}, note [133] des Déboires de Carolus) reproduit (pl. ii) la couverture d’un cahier manuscrit, conservé à la Bibliotheca Universitaria de Padoue, intitulé Pathologicæ Prælectiones habitæ in Scholis Medicorum a M. Carolo Patin Doctore Medico Parisiensi et Scholarum Professore. 1659 & 1660 [Leçons de Pathologie prononcées aux Écoles des médecins par M. Charles Patin, docteur en médecine de Paris et professeur des Écoles, en 1659 et 1660].